Al igual que el Sharingan, el Rinnegan también puede lanzar genjutsu, y la gran diferencia es que es aún más fuerte. Usando el Rinnengan, por ejemplo, Sasuke pudo atrapar a las nueve bestias con cola con una sola mirada.
Pero después de todo, ¿Pueden Tsukuyomi o Kotoamatsukami superar el genjutsu Rinnegan en Naruto Shippuden?
Según la novela, después de la Cuarta Guerra Mundial Shinobi, Sasuke Uchiha emprendió un viaje, donde dominó el genjutsu más fuerte, que obviamente se refiere a su Rinnegan. Por lo tanto, el genjutsu de Rinnegan supera a todos los demás.
Sin embargo, Kotoamatsukami fue descrito como el genjutsu definitivo, e incluso Itachi consideró que esta técnica era la definitiva a pesar de tener a Tsukuyomi. El control mental del genjutsu de Shisui es absoluto y nada puede resistirlo. Entonces, si bien la serie describe el genjutsu Rinnegan de Sasuke como el más fuerte, parece tener más sentido creer que Kotoamatsukami es en realidad incluso superior.